В состав колхидского флористического комплекса входят также многие полукустарники и травянистые растения леса: иглицы колхидская и понтийская, трахистемон восточный, толстостенка крупнолистная, морозник кавказский, дербянка колосистая и др. Понижение в западной части Главного хребта, называемое ботаниками "колхидскими воротами", способствует выравниванию климата южных и северных , склонов и проникновению реликтовых видов на склоны Кубанского Кавказа. В настоящее время их ареал в заповеднике охватывает бассейны Белой и Киши с выходом за его пределы на се вер и запад. К востоку роль колхидского подлеска снижается. К числу доледниковых реликтовых видов относятся тис ягодный и самшит колхидский. Район Хостинской тисо-самшитовой рощи находится в зоне влажных субтропиков; леса образованы 65 видами деревьев и кустарников. Наибольшая площадь принадлежит широколиственным лесам, под пологом которых пышно развит подлесок из вечнозеленых колхидских кустарников или ярус самшита (на известняках). Хвойный лес с господством (или участием) тиса занимает около 16%. На стволах деревьев обычны эпифиты, в частности на самшите - мох некера. Травяной покров в связи с затенением почвы часто не развит. Флора тисо-самшитовой рощи насчитывает более 200 видов цветковых и высших споровых растений. Среди них преобладают бореальные, значительно участие древних (третичных) и средиземноморских видов. Слабо выражена группа кавказского происхождения; эндемики составляют около 5%; отмечены адвентивные виды. Тис в заповеднике встречается повсеместно в темнохвойных лесах отдельными экземплярами и небольшими группами. Самшит кроме Хостинской рощи отмечен в бассейне Шахе, а также по склонам р. Цице (вне заповедника). До 1300 м произрастают широколиственные леса. Дубняки занимают небольшую площадь (2%) преимущественно по периферии заповедника. Они приурочены к осветленным южным склонам на высотах до 900 м. Эти леса состоят в основном из 4 видов дуба: черешчатого, скального, грузинского и Гартвиса.